Форма поиска

 

Износ оборудования

Уважаемые пользователи Гибридного кластера НР РЦ «Вычислительный центр» СПбГУ!

Ввиду износа оборудования, для расчета на гибридном кластере Hewlwtt Packard для расчета в очереди gpu8 (более трех ускорителей на узел) в рабочем состянии остался всего один узел.

Мы просим Вас, по возможности, запускать Ваши задачи в очереди gpu3, либо переходить на использование очерези gpu кластера Huawei

С Уважением, команда РЦ ВЦ. 

Новый информационный сервис

На базе РЦ ВЦ Научного парка СПбГУ развернут новый информационный сервис для оценки качества геномных сборок.

В основе сервиса - популярный пакет QUAST. QUAST вычисляет более 50 параметров качества описывающих корректность (correctness), протяженность (contiguity), полноту (completeness) геномных последовательностей и загрязненность (contamination) анализируемых данных геномного сиквенса. QUAST может обрабатывать как сборки модельных организмов с известной референсной последовательностью, так и геномные сборки организмов, секвенированных впервые. Программный пакет позволяет одновременно анализировать неограниченное число сборок, что делает его удобным инструментов для сравнения геномных последовательностей и выбора наиболее подходящей для конкретного эксперимента. Итоговые отчеты QUAST включают в себя как числовые показатели качества так и множество интерактивных графиков.

На сегодняшний день QUAST является ведущей программой для оценки качества геномных сборок, используемой в более чем 100 странах мира и скачанной более 150 тысяч раз (с момента старта проекта в 2012 году). По данным сервиса Google Scholar, статья о QUAST (Gurevich et al, Bioinformatics 2013) была процитирована более двух тысяч раз, что делает её одной из самых востребованных российских научных статей за последнее десятилетие.

Вопросы, пожелания по развитию проекта, а также любые замечания и сообщения об ошибках можно направлять на почту quast.support@cab.spbu.ru

 

ИТ-инфраструктура ВЦ – это мощный комплекс вычислительных систем, систем хранения и сетевого оборудования с большим количеством информационных и вычислительных сервисов и соответствующего программного обеспечения.
 
 

 

Использование РЦ  "Вычислительный центр СПбГУ" в рамках сервисной модели построения ИТ-инфраструктуры означает - выделение ресурсов по требованию и обеспечение качества обслуживания на согласованном уровне. Работа Центра ориентирована на предоставление услуг с помощью Интернета.