Секвенирование, ассемблинг, аннотирование, изучение набора генов, организации и эволюции МТХ генома в различных филогенетических ветвях Amoebozoa; поиск паралогов митихондриальных генов в ядерных геномах; сравнение путей эволюции ядерных и МТХ геномов этой группы протистов; реконструкция филогении базальной части древа Amoebozoa на основании анализа особенностей структуры и организации митихондриальных геномов