Форма поиска

 

Materials Studio

Materials Studio - это комплексное приложение для решения задач в области материаловедения. Materials Studio обладает широким набором инструментов для моделирования молекулярных систем разного размера на различном уровне теории, а также предоставляет интерфейс для хранения и анализа полученных данных.

Официальный сайт

Название Версия Дата установки
Materials Studio 5.5 01.12.2011
6 17.06.2013
7 20.11.2014

 

Ограничения пакета

Лицензия Исходный код Макс. число процесс. ядер Макс. число пользователей
Платная Закрытый Не ограничено 100

Лицензия доступна только сотрудникам и студентам СПбГУ и только для академического использования. Для получения доступа к ПО необходимо подать заявку на исследование через систему Научного Парка СПбГУ. Процедура получения доступа к ПО более подробно описана в разделе "Информация для пользователей".

 

Ограничения сервиса

Сервис предоставляется на следующих базовых платформах (см. ссылки для более детальной информации):

Ресурс Расположение
Версия 5.5 Версия 6 Версия 7
Виртуальная машина на базе Windows на базе Windows на базе Windows
Кластер Т-Платформы (не доступен) (не доступен) через gateway
SMP - кластер (не доступен) (не доступен) через gateway
Гибридный кластер (не доступен) (не доступен) через gateway*
Huawei кластер (не доступен) (не доступен) через gateway*

*Materials Studio не поддерживает вычисления на графических картах, поэтому на Гибридном Кластере HP и кластере Huawei доступны вычислительные очереди только с поддержкой CPU-вычислений

 

Как воспользоваться сервисом

Пользователь может запускать расчеты как на собственных виртуальных машинах на базе Windows, так и на высокопроизводительных Linux-кластерах через специальный шлюз (см. далее "Настройка шлюза для проведения расчетов на кластере")

Для запуска расчетов на необходимо выполнить следующие шаги:

1) Запустите Materials Studio на Вашей Windows-машине (соответствующие ярлыки есть на Рабочем Столе и Главном Меню)

2) Создайте новый или откройте имеющийся проект (примеры проектов можно найти в директории C:\Program Files (x86)\Accelrys\Materials Studio 7.0\share\Examples\Projects)

3) Выберите меню Modules →<необходимый модуль> → Calculation (например: Modules →CASTEP → Calculation). Появится новое окно.

4) В новом окне перейдите на вкладку "Job Control" и введите необходимые параметры и запустите расчет

Для запуска на Виртуальной Машине:

  • в списке "Gateway location" выберите: "My Computer"
  • в поле "Run in parallel on" укажите, сколько ядер CPU использовать
  • нажмите "Run" для запуска расчета

Важно! Не указывайте число ядер больше, чем есть на машине. Кроме того, если во время расчета Вы планируете активно использовать ВМ, то оставьте свободным 1-2 ядра

Для запуска на кластере:

  • предварительно настройте программу на работу со шлюзом к тому или иному кластеру (см. ниже раздел "Настройка шлюза для проведения расчетов на кластере")
  • в списке "Gateway location" выберите необходимый шлюз
  • в списке "Queue" укажите очередь с поддержкой CPU-вычислений (список всех очередей можно посмотреть здесь)
  • в поле "Run in parallel on" укажите, сколько ядер CPU использовать
  • нажмите "Run" для запуска расчета

Важно!

  • Максимальное число доступных ядер на задачу ограничено в зависимости от кластера и очереди. Ограничения можно посмотреть здесь
  • При первом обращении к шлюзу после запуска Materials Studio, Вы увидите окно для аутентификации, в котором нужно ввести Ваши учетные данные для доступа на сайт cc.spbu.ru
  • Если в списке нет нужного шлюза, попробуйте полностью перезапустить программу и проверить снова. Если это не поможет, обратитесь в нашу тех. поддержку по адресу support@cc.spbu.ru
  • Вы можете контролировать состояние шлюза и запущенных задач через Web-интерфейс шлюза (см. ниже раздел "Веб-интерфейс для контроля состояния шлюза")

5) Состояние выполнения расчета Вы можете отслеживать в разделе "Jobs". По окончании расчетов появится окно со статусом завершения задачи, а результаты станут доступны в разделе "Projects"