Форма поиска

 

GROMACS

Описание

Название Версия Дата установки
GROMACS 4.5.5 01.12.2011

 

GROMACS (GROningen MAchine for Chemical Simulations, дословный перевод названия  — Гронингенская Машина для Химического Моделирования) - пакет для моделирования физико-химических процессов, первоначально разработанный группой Германа Берендсена из департамента биофизической химии Гронингенского университета, сейчас развивается и поддерживается благодаря усилиям энтузиастов из разных стран, включая университет Уппсалы и Королевский технологический институт. Пакет предназначался в основом для моделирования биомолекул (белки и липиды), имеющих много связанных взаимодействий между атомами. Однако GROMACS отлично показал себя и на расчетах для несвязанных взаимодействий. Поэтому он считается одним из самых быстрых инструментов для решения указанных задач. GROMACS является программным обеспечением с открытым исходным кодом, выпущенным под лицензией GPL.

Для получения доступа к ПО необходимо подать заявку на иссследование через систему Научного Парка СПбГУ. Процедура получения доступа к ПО более подродно описана в разделе "Информация для пользователей". 

Пользователи РЦ ВЦ, имеющим ВМ Linux, имеют доступ к данному ПО по умолчанию.

Ограничения пакета

Лицензия Исходный код Макс. число процесс. ядер Макс. число пользователей
Бесплатная Открытый Не ограничено Не ограничено

Бесплатная лицензия. Нет ограничений на число процессорных ядер и число пользователей.

Ограничения сервиса

Ресурс Расположение
Версия 4.5.5
Виртуальная машина /usr/local/GROMACS/gromacs/
Виртуальный кластер VM /usr/local/GROMACS/gromacs/
Кластер Т-Платформы /usr/local/GROMACS/gromacs/
SMP - кластер (не доступен)
Гибридный кластер (не доступен)

В данный момент сервис доступен лишь на кластере Т-Платформы, виртуальном кластере и на персональных виртуальных машинах пользователей.

Ограничения отдельных кластеров и их очередей указаны на соответствующих страницах (ссылка в столбце "Ресурс").